生信分析平台搭建（十七）：服务器配置

熟悉完虚拟机配置服务器之后，就可以尝试上手搭建实体服务器了，如果要选购服务器，应该考虑哪些因素呢？如果不差钱，那就好办了，直接选最贵的就好了。在预算有限的条件下。CPU，内存，硬盘如何取舍，达到最佳性能，是否需要购买UPS，显卡是否有必要？这些问题，我们一文解决这些疑问。

二十二：服务器配置

1、CPU

CPU是计算机的大脑，计算机的计算主要就是靠CPU来完成，所以，CPU非常重要，CPU的计算速度决定了计算机的计算能力。也就是水桶效应中最上面的那块木板。比如序列拼接这个工作，需要将测序的reads切成更小 的片段，然后将这些小片段根据序列间的关系，连成更长的片段，那么这些片段有数百万至数千万，需要非常大的计算量。如果数据复杂，计算量就更大了。

另外，CPU还需要支持多核心，CPU是大脑，一个核心是一个心眼儿，所以，我们知道心眼越多的人越聪明。多核心就可以进行并行计算，在生物信息分析中，有些工作，可以进行并行计算。相当于原来一个人的工作，现在由100个同样的人来做，理论上速度快了100倍。因此，在硬件配置中，选择CPU是非常重要的。

2、内存

内存是CPU和硬盘之间数据交流的媒介，计算机需要将存储在硬盘上的数据读取到内存中，CPU才能用来计算，而CPU不能直接读取硬盘上的数据，必须通过内存这个缓冲区，举个例子，CPU是大脑，内存是脖子，脖子以下是硬盘。内存往往就是“瓶颈”。

假设一个人的全基因组测序数据，采用二代测序的方法，人的基因组3G，10被数据30G，那么这30G的碱基，在切成更小的kmer，假设数据增加到了100G，还不算存储序列的一些其他信息，序列拼接的时候必须一次将所有数据同时存入内存，如果内存达不到100G，拼接根本无法完成。

3、硬盘

硬盘其实是计算机硬件配置中非常重要的一环，但是硬盘往往容易被大家忽略掉，认为硬盘用来存储数据，只要需要足够大就行了，这是不对的。

首先大存储量是必须的，因为生物数据往往都称为生物大数据，非常消耗存储空间，包括原始的数据存储，中间分析结果，最终结果，数据备份等，尤其是在样品量大的时候，就会非常占据存储空间，一般都是以T为单位的。

其次，硬盘的读写速度，这个也是非常重要的因素，因为目前CPU计算速度和内存已经足够大了，这样的条件下，硬盘成为限制计算机整体性能的因素。因此使用SSD硬盘会明显改善计算机性能。由于目前SSD过于昂贵，可以选择SSD+机械硬盘的方案，硬盘要做成RAID提高读写速度和数据安全性。

4、显卡

可以选配显卡，这个并不是必须的，因为很多分析工作都是文本操作，显卡适合于图形计算，例如计算蛋白质空间结构，构建系统网络等，可以选择配置显卡。

5、不间断电源UPS

UPS相当于一个大的移动电源，为了防止突然断电，导致数据丢失。UPS还是非常重要的。有些生物计算需要持续很长时间，例如拼接一个大的基因组，构建一个大的系统发育树等可能数十天时间，一旦断电，损失非常大，不要心存侥幸心理，灾难往往就发生在那些心存侥幸心理的人身上。

6、其他

冷却系统，如果是大型计算系统，设备会产生大量热量，需要建设冷却系统。

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我不大明白楼主是在本地机设置 DNS 服务器地址还是架设DNS服务器。

如果设置本地机DNS服务器地址，比较简单，在桌面上 右键单击“网上邻居”选“属性”，双击“本地连接”选“属性”按钮，然后双击“TCP/IP”协议，在弹出的对话框中，便可以设置DNS服务器的地址，

如果楼主要架设DNS服务器，为网络中的其他用户提供DNS服务，那就复杂了。也不知道您的老师对您的答案有什么要求，是详细，还是说个大概？我看咱们还是尽量说得细一点吧。

首先，机器要装WIN2000，WIN2003，LINUX等系统，这里以WIN2000为例。

您首先要把自己手里的这台电脑指定为运行数据和解析网络地址的的硬件设备。您需要将本机I P地址或计算机名称指定给D N S服务器，这样D N S服务器会自动与您的计算机硬件建立连接，并启用所需的设备完成数据运算和解析网络地址的工作。具体创建过程，操作步骤如下：

1 打开“开始”菜单，选择“程序” |“管理工具”|“D N S”命令，打开“ D N S控制台窗口”（必须是在WIN2000或WIN2003服务器版上才有，专业版及家庭版XP都没有这个选项）。

2 打开“操作”菜单，选择“连接计算机”命令，打开“选择目标机器”对话框。

3 如果您要在本机上运行D N S服务器，请选定“这台计算机”单选按钮。

如果您不希望本机运行D N S服务器，请选定“另一台计算机”单选按钮，然后在“另一台计算机”后面的文本框中输入要运行D N S服务器的计算机的名称。

4 如果您希望立即与这台计算机进行连接，请选定“立即连接到这台计算机”复选框。

5 单击“ 确定” 按钮，返回到“D N S控制台窗口”，这时在控制台目录树中将显示代表D N S服务器的图标和计算机的名称。

创建一个D N S服务器，除了需要必需的计算机硬件外，还需要建立一个新的区域即一个数据库才能正常运作。该数据库的功能是提供D N S名称和相关数据（如I P地址或网络服务）间的映射。该数据库中存储了所有的域名与对应I P地址的信息，网络客户机正是通过该数据库的信息来完成从计算机名到I P地址的转换。下面将对创建区域进行具体的介绍，操作步骤如下：

1 在“D N S控制台”窗口中，打开“操作”菜单，选择“创建新区域”命令，打开“欢迎使用创建新区域向导”对话框。

2 单击“下一步”按钮，打开“选择一个区域类型”对话框。

3 在“选择一个区域类型”对话框中有三个选项，分别是：集成的Active Directory、标准主要区域和标准辅助区域。您可以根据区域存储和复制的方式选择一个区域类型。如果您希望新建的区域使用活动目录，可选定“集成的Active Directory”。

4 单击“下一步”按钮，打开“选择区域搜索类型”对话框。

5 在“选择区域搜索类型”对话框中用户可以选择“反向搜索”或“正向搜索”单选按钮。如果您希望把名称映射到地址并给出提供的服务的信息，应选定“正向搜索”单选按钮。如果您希望把机器的I P地址映射到用户好记的域名，应选定“反向搜索”单选按钮。这里我们选择“反向搜索”单选按钮。

6 单击“下一步”按钮，打开“网络I D”对话框。

7 默认情况下“创建新区域向导”会选定“输入反向搜索区域的网络标识和子网掩码”单选按钮，您必须在“网络标识”和“子网掩码”文本框中输入正确的I P地址和相应的子网掩码。如果不希望使用系统默认的反向搜索区域的名称，可以单击“输入反向搜索区域的名称”单选按钮，然后在“名称”文本框中输入自己喜欢的名称。

8 单击“下一步”按钮，打开“正完成‘创建新区域向导’”对话框。

9 在“正完成‘创建新区域向导’”对话框中显示了您对新建区域进行配置的信息，如果您认为某项配置需要调整，单击“上一步”按钮返回到前面的对话框中重新配置。如果确认了自己配置正确的话，可单击“完成”按钮，打开“ D N S”对话框。

10 创建新区域向导提示用户新区域已经创建成功。您可单击“确定”按钮完成所有创建工作。如果您再次打开“DNS控制台”窗口，单击“服务器”根节点展开该节点，然后单击“反向搜索区域”节点展开该节点，您可以看到新建的区域显示在反向搜索区域节点的下面。

您在完成了上面的一些有关D N S服务器的创建工作后，还需要对D N S服务器的一些重要的属性进行设置。因为，属性设置是保证D N S服务器稳定、安全运行的必要条件。毕竟您是在做题，各选项卡，LWH等设置便不细细讲了，希望对您有所帮助。

DNS服务器安装

1、打开“添加角色”，安装DNS服务。点击下一步，安装，开始启动dns服务器进行配置，

2、首先配置dns服务器，

3、进入后点击下一步，输入区域名称，点击下一步进入转发器点击否。

点击下一步，完成，

配置dns服务器

1、点击新建主机，

2、这里新建主机你可以新建一个web网站域名或者别的FTP站点域名等

名称为自定义

IP地址为虚拟机配置的静态ip地址

记得勾上下面的框框如果出现提示选择是可能是没有配置反向查找区域的问题，

3、配置反向查找区域，点击新建区域，点击下一步，

4、进入反向区域查找名称配置输入网络号，点击下一步，完成，

5、双击进入，

6、新建指针

主机IP地址为虚拟机ip地址

主机名为正向查找区域的域名。

最后确定配置完成，

7、最后ping一下你的域名能不能成功解析

配置虚拟机的dns地址为虚拟机ip

提供一个清理dns缓存的命令。ipconfig/flushdns

清除DNS解析程序缓存。

最好在配置前执行一下这条命令

打开“DNS管理工具” ， 在左侧的“反向查找区域” 上单击鼠标右键， 在弹出的菜单中选择“新建区域”

进入“新建区域向导” 欢迎界面

进入“区域类型” 选择界面， 选择区域类型为： “主要区域”

进入“反向查找区名称” 设置界面， 使用系统默认“IPv4反向查找区域”

在“网络ID” 中输入IPv4的网络ID号： 19216883

进入“区域文件” 界面， 使用系统默认文件名

进入“动态更新” 设置界面， 选择最下面的“不允许动态更新”

进入“新建区域向导” 完成界面， 显示了前面设置的信息

指针记录即反向解析记录， 用于记录IP地址所对应的域名， 是反向解析区中最常用的记录。

在新建的反向解析区上单击鼠标右键， 在弹出的菜单中选择“新建指针”

在“主机IP地址” 中输入IP地址： 19216883201

在“主机名” 中输入本域名服务器的域名： dns1fjnueducn

或者直接浏览选择主机名后，系统会自动填写主机IP地址和主机名。

依次为dns2、ftp、www、mail创建对应的指针记录

输入命令nslookup， 进入nslookup命令环境， 输入IP地址， 即可得到该IP对应的域名

如果是思科的Packet

Tracer，直接在服务器上配置--DNS--输入IP和域名新增即可。

如果是命令行,服务器段配置：

switch(config)#ip

domain-nane

ciscocom

switch(config)#ip

name-server

1011209

1011210

switch(config)#ip

domain-lookup

客户端：(config)#ip

name-server

1011209